Ruoka- ja ympäristöallergioiden ja yliherkkyyksien on havaittu olevan yhteydessä lukuisaan määrään erilaisia sairauksia, lähtien lievistä ruuansulatusongelmista ja mahaärsytyksestä aina vaikeampiasteisiin sairauksiin, kuten keliakiaan, artriittiin ja kroonisiin tulehduksiin.

Allergiat saattavat myös liittyä keskushermoston eriasteisiin häiriöihin kuten depressioon, ahdistukseen ja krooniseen väsymykseen.

Ruoka-allergiat ja yliherkkyydet aktivoivat immuunisysteemiä syntetisoimaan ja vapauttamaan reaktiivisia kemikaaleja, kuten histamiinia, sytokiineja, lymfokiineja ja interferoneja. Nämä aineet voivat huomattavasti muuttaa solujen fysiologiaa, aiheuttamalla muutoksia immuuni-, sisäeritys- ja hermostosysteemeissä.